Baktığımız her yerde doğal seçilime bir kanıt görüyormuşuz gibi gelebilir: organizmalar bulundukları çevrelere oldukça iyi uyarlanmış gibidir. Fakat moleküler evrimin nötral kuramı, popülasyon içindeki çoğu genetik çeşitliliğin doğal seçilimin değil, mutasyon ve sürüklenmenin bir sonucu olduğunu söyler Temel olarak bu kuram, eğer bir popülasyon bir genin farklı çeşitlerini barındırıyorsa, bu çeşitlerin her birinin kendi işini diğerleri kadar iyi gördüğünü söyler. Diğer bir deyişle çeşitlilik yansızdır, genin A versiyonunu ya da B versiyonunu taşıyor olmak seçilim değerini
değiştirmez. Nötral kuram kolaylıkla yanlış yorumlanabilir. Kuram şunları SÖYLEMEZ:
• Organizmalar çevrelerine uyarlanmamışlardır
• Tüm morfolojik çeşitlilikler etkisizdir
• TÜM genetik çeşitlilikler etkisizdir
• Doğal seçilim genom düzenlenmesinde önemli rol oynamaz
Nötral kuramın temel noktası basitçe, bir popülasyonda bir genin birkaç çeşidini görüyorsak bunların sıklıklarının sadece rasgele sürükleniyor olabildiğidir. Nötral kuramı destekleyen ve yanlışlayan veriler çetrefillidir. Nötral kuramın ne derecede etkili olduğunun ortaya çıkarılması için daha fazla araştırmaya ihtiyaç var.